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Bacterial genomic epidemiology, from local outbreak characterization to species-history reconstruction 1-gen-2015 Gaiarsa, Stefano; DE MARCO, Leone; Comandatore, Francesco; Marone, P; Bandi, C; Sassera, Davide
Genomic Characterization Helps Dissecting an Outbreak of Listeriosis in Northern Italy 1-gen-2017 Comandatore, Francesco; Corbella, Marta; Andreoli, Giuseppina; Scaltriti, Erika; Aguzzi, Massimo; Gaiarsa, Stefano; Mariani, Bianca; Morganti, Marina; Bandi, Claudio; Fabbi, Massimo; Marone, Piero; Pongolini, Stefano; Sassera, Davide
ST405 NDM-5 producing Escherichia coli in Northern Italy: The first two clinical cases 1-gen-2017 Bitar, Ibrahim; Piazza, Aurora; Gaiarsa, Stefano; Villa, L.; Pedroni, P.; Oliva, E.; Nucleo, Elisabetta; Pagani, Laura; Carattoli, A.; Migliavacca, Roberta
A novel IncA/C1 group conjugative plasmid, encoding VIM-1 metallo-beta-lactamase, mediates the acquisition of carbapenem resistance in ST104 Klebsiella pneumoniae isolates from neonates in the intensive care unit of V. Monaldi Hospital in Naples 1-gen-2017 Esposito, Eliana P.; Gaiarsa, Stefano; Del Franco, Mariateresa; Crivaro, Valeria; Bernardo, Mariano; Cuccurullo, Susanna; Pennino, Francesca; Triassi, Maria; Marone, Piero; Sassera, Davide; Zarrilli, Raffaele
Shifts of Faecal Microbiota During Sporadic Colorectal Carcinogenesis 1-gen-2018 Mori, G; Rampelli, S; Orena, Bs; Rengucci, C; De Maio, G; Barbieri, G; Passardi, A; Casadei Gardini, A; Frassineti, Gl; Gaiarsa, S; Albertini, Am; Ranzani, Gn; Calistri, D; Pasca, Mr
Characterization of an Outbreak of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Klebsiella pneumoniae in a Neonatal Intensive Care Unit in Italy 1-gen-2018 Corbella, Marta; Caltagirone, Mariasofia; Gaiarsa, Stefano; Mariani, Bianca; Sassera, Davide; Bitar, Ibrahim; Muzzi, Alba; Migliavacca, Roberta; Scudeller, Luigia; Stronati, Mauro; Cambieri, Patrizia
Multiple Klebsiella pneumoniae KPC Clones Contribute to an Extended Hospital Outbreak 1-gen-2019 Ferrari, Carolina; Corbella, M.; Gaiarsa, S.; Comandatore, F.; Scaltriti, E.; Bandi, C.; Cambieri, P.; Marone, P.; Sassera, D.
Gene Composition as a Potential Barrier to Large Recombinations in the Bacterial Pathogen Klebsiella pneumoniae 1-gen-2019 Comandatore, Francesco; Sassera, D.; Bayliss, S. C.; Scaltriti, E.; Gaiarsa, S.; Cao, Xuan; Gales, A. C.; Saito, R.; Pongolini, S.; Brisse, S.; Feil, E. J.; Bandi, C.
Comparative analysis of the two Acinetobacter baumannii multilocus sequence typing (MLST) schemes 1-gen-2019 Gaiarsa, S.; BATISTI BIFFIGNANDI, Gherard; Esposito, E. P.; Castelli, M.; Jolley, K. A.; Brisse, S.; Sassera, D.; Zarrilli, R.
Deianiraea, an extracellular bacterium associated with the ciliate Paramecium, suggests an alternative scenario for the evolution of Rickettsiales 1-gen-2019 Castelli, M.; Sabaneyeva, E.; Lanzoni, O.; Lebedeva, N.; Floriano, A. M.; Gaiarsa, S.; Benken, K.; Modeo, L.; Bandi, C.; Potekhin, A.; Sassera, D.; Petroni, G.
Rickettsia buchneri, symbiont of the deer tick Ixodes scapularis, can colonise the salivary glands of its host 1-gen-2020 Al-Khafaji, A. M.; Armstrong, S. D.; Varotto Boccazzi, I.; Gaiarsa, S.; Sinha, A.; Li, Z.; Sassera, D.; Carlow, C. K. S.; Epis, S.; Makepeace, B. L.
Lack of SARS-CoV-2 RNA environmental contamination in a tertiary referral hospital for infectious diseases in Northern Italy 1-gen-2020 Colaneri, M.; Seminari, E.; Piralla, A.; Zuccaro, V.; Di Filippo, A.; Baldanti, F.; Bruno, R.; Mondelli, M. U.; Brunetti, E.; Di Matteo, A.; Maiocchi, L.; Pagnucco, L.; Mariani, B.; Ludovisi, S.; Lissandrin, R.; Parisi, A.; Sacchi, P.; Patruno, S. F. A.; Michelone, G.; Gulminetti, R.; Zanaboni, D.; Novati, S.; Maserati, R.; Orsolini, P.; Vecchia, M.; Sciarra, M.; Asperges, E.; Sambo, M.; Biscarini, S.; Lupi, M.; Roda, S.; Chiara Pieri, T.; Gallazzi, I.; Sachs, M.; Valsecchi, P.; Perlini, S.; Alfano, C.; Bonzano, M.; Briganti, F.; Crescenzi, G.; Giulia Falchi, A.; Guarnone, R.; Guglielmana, B.; Maggi, E.; Martino, I.; Pettenazza, P.; Pioli di Marco, S.; Quaglia, F.; Sabena, A.; Salinaro, F.; Speciale, F.; Zunino, I.; De Lorenzo, M.; Secco, G.; Dimitry, L.; Cappa, G.; Maisak, I.; Chiodi, B.; Sciarrini, M.; Barcella, B.; Resta, F.; Moroni, L.; Vezzoni, G.; Scattaglia, L.; Boscolo, E.; Zattera, C.; Michele Fidel, T.; Vincenzo, C.; Vignaroli, D.; Bazzini, M.; Iotti, G.; Mojoli, F.; Belliato, M.; Perotti, L.; Mongodi, S.; Tavazzi, G.; Marseglia, G.; Licari, A.; Brambilla, I.; Daniela, B.; Antonella, B.; Patrizia, C.; Giulia, C.; Giuditta, C.; Marta, C.; D'Alterio, Rossana; Milena, F.; Bianca, M.; Roberta, M.; Enza, M.; Stefania, P.; Maurizio, P.; Elena, P.; Antonio, P.; Francesca, R.; Antonella, S.; Maurizio, Z.; Guy, A.; Laura, B.; Ermanna, C.; Giuliana, C.; Luca, D.; Gabriella, F.; Gabriella, G.; Alessia, G.; Viviana, L.; Meisina, Claudia; Valentina, M.; Simona, P.; Marta, P.; Alice, B.; Giacomo, C.; Irene, C.; Alfonso, C.; Di Martino, R.; Di Napoli, A.; Alessandro, F.; Guglielmo, F.; Loretta, F.; Federica, G.; Albertini, Alessandra; Federica, N.; Giacomo, R.; Beatrice, R.; Maria, S. I.; Monica, T.; Nepita Edoardo, V.; Calvi, M.; Tizzoni, M.; Nicora, C.; Triarico, A.; Petronella, V.; Marena, C.; Muzzi, A.; Lago, P.; Comandatore, F.; Bissignandi, G.; Gaiarsa, S.; Rettani, M.; Bandi, C.
Clinical characteristics of coronavirus disease (COVID-19) early findings from a teaching hospital in Pavia, North Italy, 21 to 28 February 2020 1-gen-2020 Colaneri, M.; Sacchi, P.; Zuccaro, V.; Biscarini, S.; Sachs, M.; Roda, S.; Pieri, T. C.; Valsecchi, P.; Piralla, A.; Seminari, E.; Matteo, A. D.; Novati, S.; Maiocchi, L.; Pagnucco, L.; Tirani, M.; Baldanti, F.; Mojoli, F.; Perlini, S.; Bruno, R.; Mondelli, M. U.; Brunetti, E.; Mariani, B.; Ludovisi, S.; Lissandrin, R.; Parisi, A.; Patruno, S. F. A.; Michelone, G.; Gulminetti, R.; Zanaboni, D.; Maserati, R.; Orsolini, P.; Vecchia, M.; Asperges, E.; Filippo, A. D.; Sambo, M.; Lupi, M.; Gallazzi, I.; Alfano, C.; Bonzano, M.; Briganti, F.; Crescenzi, G.; Falchi, A. G.; Guarnone, R.; Guglielmana, B.; Maggi, E.; Martino, I.; Pettenazza, P.; di Marco, S. P.; Quaglia, F.; Sabena, A.; Salinaro, F.; Speciale, F.; Zunino, I.; de Lorenzo, M.; Secco, G.; Dimitry, L.; Cappa, G.; Maisak, I.; Chiodi, B.; Sciarrini, M.; Barcella, B.; Resta, F.; Moroni, L.; Vezzoni, G.; Scattaglia, L.; Boscolo, E.; Zattera, C.; Fidel, T. M.; Vincenzo, C.; Vignaroli, D.; Bazzini, M.; Iotti, G.; Belliato, M.; Perotti, L.; Mongodi, S.; Tavazzi, G.; Marseglia, G.; Licari, A.; Brambilla, I.; Daniela, B.; Antonella, B.; Patrizia, C.; Giulia, C.; Giuditta, C.; Marta, C.; D'Alterio, Rossana; Milena, F.; Bianca, M.; Roberta, M.; Enza, M.; Stefania, P.; Maurizio, P.; Elena, P.; Francesca, R.; Antonella, S.; Maurizio, Z.; Marone, P.; Guy, A.; Laura, B.; Ermanna, C.; Giuliana, C.; Luca, D.; Gabriella, F.; Gabriella, G.; Alessia, G.; Viviana, L.; Claudia, L.; Valentina, M.; Simona, P.; Marta, P.; Alice, B.; Giacomo, C.; Irene, C.; Alfonso, C.; Raffella, D. M.; Annapia, D. N.; Alessandro, F.; Guglielmo, F.; Loretta, F.; Federica, G.; Albertini, Alessandra; Federica, N.; Giacomo, R.; Beatrice, R.; Maria, S. I.; Monica, T.; Edoardo, V. N.; Calvi, M.; Tizzoni, M.; Nicora, C.; Triarico, A.; Petronella, V.; Marena, C.; Muzzi, A.; Cutti, S.; Novelli, V.; Lago, P.; Comandatore, F.; Gaiarsa, S.; Rettani, M.; Bandi, C.; Ferrari, A.
Bispecific IgG neutralizes SARS-CoV-2 variants and prevents escape in mice 1-gen-2021 De Gasparo, R.; Pedotti, M.; Simonelli, L.; Nickl, P.; Muecksch, F.; Cassaniti, I.; Percivalle, E.; Lorenzi, J. C. C.; Mazzola, F.; Magri, D.; Michalcikova, T.; Haviernik, J.; Honig, V.; Mrazkova, B.; Polakova, N.; Fortova, A.; Tureckova, J.; Iatsiuk, V.; Di Girolamo, S.; Palus, M.; Zudova, D.; Bednar, P.; Bukova, I.; Bianchini, F.; Mehn, D.; Nencka, R.; Strakova, P.; Pavlis, O.; Rozman, J.; Gioria, S.; Sammartino, J. C.; Giardina, F.; Gaiarsa, S.; Pan-Hammarstrom, Q.; Barnes, C. O.; Bjorkman, P. J.; Calzolai, L.; Piralla, A.; Baldanti, F.; Nussenzweig, M. C.; Bieniasz, P. D.; Hatziioannou, T.; Prochazka, J.; Sedlacek, R.; Robbiani, D. F.; Ruzek, D.; Varani, L.
EBV DNA increase in COVID-19 patients with impaired lymphocyte subpopulation count 1-gen-2021 Paolucci, S.; Cassaniti, I.; Novazzi, F.; Fiorina, L.; Piralla, A.; Comolli, G.; Bruno, R.; Maserati, R.; Gulminetti, R.; Novati, S.; Mojoli, F.; Baldanti, F.; Bruno, R.; Mondelli, M.; Brunetti, E.; Di Matteo, A.; Seminari, E.; Maiocchi, L.; Zuccaro, V.; Pagnucco, L.; Mariani, B.; Ludovisi, S.; Lissandrin, R.; Parisi, A.; Sacchi, P.; Patruno, S. F. A.; Michelone, G.; Gulminetti, R.; Zanaboni, D.; Novati, S.; Maserati, R.; Orsolini, P.; Vecchia, M.; Sciarra, M.; Asperges, E.; Colaneri, M.; Di Filippo, A.; Sambo, M.; Biscarini, S.; Lupi, M.; Roda, S.; Pieri, T. C.; Gallazzi, I.; Sachs, M.; Valsecchi, P.; Perlini, S.; Alfano, C.; Bonzano, M.; Briganti, F.; Crescenzi, G.; Falchi, A. G.; Guarnone, R.; Guglielmana, B.; Maggi, E.; Martino, I.; Pettenazza, P.; Pioli di Marco, S.; Quaglia, F.; Sabena, A.; Salinaro, F.; Speciale, F.; Zunino, I.; De Lorenzo, M.; Secco, G.; Dimitry, L.; Cappa, G.; Maisak, I.; Chiodi, B.; Sciarrini, M.; Barcella, B.; Resta, F.; Moroni, L.; Vezzoni, G.; Scattaglia, L.; Boscolo, E.; Zattera, C.; Tassi, M. F.; Capozza, V.; Vignaroli, D.; Bazzini, M.; Iotti, G.; Mojoli, F.; Belliato, M.; Perotti, L.; Mongodi, S.; Tavazzi, G.; Marseglia, G.; Licari, A.; Brambilla, I.; Barbarini, D.; Bruno, A.; Cambieri, P.; Campanini, G.; Cavanna, C.; Comolli, G.; Corbella, M.; Daturi, R.; Furione, M.; Marone, P.; Monzillo, E.; Paolucci, S.; Parea, M.; Percivalle, E.; Piralla, A.; Rovida, F.; Sarasini, A.; Zavattoni, M.; Adzasehoun, G.; Ardizzone, M.; Bellotti, L.; Brunco, V.; Cabano, E.; Casali, G.; Capella, L.; Devitis, D.; Dossena, L.; Frisco, G.; Garbagnoli, G.; Gardellini, F.; Girello, A.; Guerrizio, A.; Landini, V.; Lucchelli, C.; Maliardi, V.; Piemontese, P.; Pezzaia, S.; Premoli, M.; Rebuffa, C.; Zanello, C.; Bagnarino, J.; Bergami, F.; Bonetti, A.; Caneva, G.; Cassaniti, I.; Corcione, A.; Di Martino, R.; Di Napoli, A.; Ferrari, A.; Ferrari, G.; Fiorina, L.; Gallone, A.; Giardina, F.; Girardi, A.; Mercato, A.; Merla, C.; Novazzi, F.; Ratano, G.; Rossi, B.; Saveriaempillai, G.; Sciabica, I. M.; Tallarita, M.; Vecchio Nepita, E.; Vitali, J.; Cerino, A.; Varchetta, S.; Oliviero, B.; Mantovani, S.; Mele, D.; Calvi, M.; Tizzoni, M.; Nicora, C.; Triarico, A.; Petronella, V.; Marena, C.; Muzzi, A.; Lago, P.; Cutti, S.; Novelli, V.; Comandatore, F.; Batistibiffignandi, G.; Gaiarsa, S.; Rettani, M.; Bandi, C.
Epidemiological Characterization of Listeria monocytogenes Infections in Pavia Province in 2017 Reveals the Presence of Multiple Concurrently Circulating Strains 1-gen-2021 Merla, C.; Corbella, M.; Biffignandi, G. B.; Gaiarsa, S.; Castelli, M.; Andreoli, G.; Fabbi, M.; Mariani, B.; Sassera, D.; Marone, P.; Cambieri, P.
Livestock-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus in inpatients: a snapshot from an Italian hospital 1-gen-2022 Merla, C; Kuka, A; Petazzoni, G; Postiglione, U; Zatelli, M; Gaiarsa, S; Mariani, B; Corbella, M; Marone, P; Sassera, D; Cambieri, P
Isolation of a Colistin-Susceptible MDR Pantoea calida Harboring the mcr-9 Gene Suggests the Silent Spread of the Resistance Factor 1-gen-2022 Gaiarsa, Stefano; Merla, Cristina; Corbella, Marta; Mariani, Bianca; Zatelli, Michela; Sciabica, Irene; Castelli, Michele; Piazza, Aurora; Zecca, Marco; Sassera, Davide; Cambieri, Patrizia
Comparative analysis of SARS-CoV-2 quasispecies in the upper and lower respiratory tract shows an ongoing evolution in the spike cleavage site 1-gen-2022 Gaiarsa, Stefano; Giardina, Federica; Batisti Biffignandi, Gherard; Ferrari, Guglielmo; Piazza, Aurora; Tallarita, Monica; Novazzi, Federica; Bandi, Claudio; Paolucci, Stefania; Rovida, Francesca; Campanini, Giulia; Piralla, Antonio; Baldanti, Fausto
Spread of multiple SARS-CoV-2 lineages April-August 2020 anticipated the second pandemic wave in Lombardy (Italy) 1-gen-2022 Tallarita, Monica; Giardina, Federica; Novazzi, Federica; Gaiarsa, Stefano; Batisti Biffignandi, Gherard; Paolucci, Stefania; Rovida, Francesca; Piralla, Antonio; Baldanti, Fausto
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