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Bacterial genomic epidemiology, from local outbreak characterization to species-history reconstruction 1-gen-2015 Gaiarsa, Stefano; DE MARCO, Leone; Comandatore, Francesco; Marone, P; Bandi, C; Sassera, Davide
Transcriptome of larvae representing the Rhipicephalus sanguineus complex 1-gen-2017 DE MARCO, Leone; Epis, S; Comandatore, Francesco; Porretta, D; Cafarchia, C; Mastrantonio, V; Dantas Torres, F; Otranto, D; Urbanelli, S; Bandi, C; Sassera, Davide
Genomic Characterization Helps Dissecting an Outbreak of Listeriosis in Northern Italy 1-gen-2017 Comandatore, Francesco; Corbella, Marta; Andreoli, Giuseppina; Scaltriti, Erika; Aguzzi, Massimo; Gaiarsa, Stefano; Mariani, Bianca; Morganti, Marina; Bandi, Claudio; Fabbi, Massimo; Marone, Piero; Pongolini, Stefano; Sassera, Davide
A metagenomic-based, cross-seasonal picture of fungal consortia associated to Italian soils subjected to different agricultural managements 1-gen-2017 Panelli, Simona; Capelli, Enrica; Comandatore, Francesco; Landinez Torres, Angela; Granata, MIRKO UMBERTO; Tosi, Solveig; Picco, ANNA MARIA
The choreography of the chemical defensome response to insecticide stress: insights into the Anopheles stephensi transcriptome using RNA-Seq. 1-gen-2017 DE MARCO, Leone; Sassera, Davide; Epis, S; Mastrantonio, V; Ferrari, M; Ricci, I; Comandatore, Francesco; Bandi, C; Porretta, D; Urbanelli, S.
First report of an ST410 OXA-181 and CTX-M-15 coproducing Escherichia coli clone in Italy: A whole-genome sequence characterization 1-gen-2018 Piazza, A.; Comandatore, F.; Romeri, F.; Pagani, C.; Floriano, A. M.; Ridolfo, A.; Antona, C.; Brilli, M.; Mattioni Marchetti, V.; Bandi, C.; Gismondo, M. R.; Rimoldi, S. G.
A meta-barcoding analysis of soil mycobiota of the upper Andean Colombian agro-environment 1-gen-2019 Landinez-Torres, Angela; Panelli, Simona; Picco, ANNA MARIA; Comandatore, Francesco; Tosi, Solveig; Capelli, Enrica
Multiple Klebsiella pneumoniae KPC Clones Contribute to an Extended Hospital Outbreak 1-gen-2019 Ferrari, Carolina; Corbella, M.; Gaiarsa, S.; Comandatore, F.; Scaltriti, E.; Bandi, C.; Cambieri, P.; Marone, P.; Sassera, D.
SeqDeχ: A Sequence Deconvolution Tool for Genome Separation of Endosymbionts From Mixed Sequencing Samples 1-gen-2019 Chiodi, A.; Comandatore, F.; Sassera, D.; Petroni, G.; Bandi, C.; Brilli, M.
Gene Composition as a Potential Barrier to Large Recombinations in the Bacterial Pathogen Klebsiella pneumoniae 1-gen-2019 Comandatore, Francesco; Sassera, D.; Bayliss, S. C.; Scaltriti, E.; Gaiarsa, S.; Cao, Xuan; Gales, A. C.; Saito, R.; Pongolini, S.; Brisse, S.; Feil, E. J.; Bandi, C.
Clinical characteristics of coronavirus disease (COVID-19) early findings from a teaching hospital in Pavia, North Italy, 21 to 28 February 2020 1-gen-2020 Colaneri, M.; Sacchi, P.; Zuccaro, V.; Biscarini, S.; Sachs, M.; Roda, S.; Pieri, T. C.; Valsecchi, P.; Piralla, A.; Seminari, E.; Matteo, A. D.; Novati, S.; Maiocchi, L.; Pagnucco, L.; Tirani, M.; Baldanti, F.; Mojoli, F.; Perlini, S.; Bruno, R.; Mondelli, M. U.; Brunetti, E.; Mariani, B.; Ludovisi, S.; Lissandrin, R.; Parisi, A.; Patruno, S. F. A.; Michelone, G.; Gulminetti, R.; Zanaboni, D.; Maserati, R.; Orsolini, P.; Vecchia, M.; Asperges, E.; Filippo, A. D.; Sambo, M.; Lupi, M.; Gallazzi, I.; Alfano, C.; Bonzano, M.; Briganti, F.; Crescenzi, G.; Falchi, A. G.; Guarnone, R.; Guglielmana, B.; Maggi, E.; Martino, I.; Pettenazza, P.; di Marco, S. P.; Quaglia, F.; Sabena, A.; Salinaro, F.; Speciale, F.; Zunino, I.; de Lorenzo, M.; Secco, G.; Dimitry, L.; Cappa, G.; Maisak, I.; Chiodi, B.; Sciarrini, M.; Barcella, B.; Resta, F.; Moroni, L.; Vezzoni, G.; Scattaglia, L.; Boscolo, E.; Zattera, C.; Fidel, T. M.; Vincenzo, C.; Vignaroli, D.; Bazzini, M.; Iotti, G.; Belliato, M.; Perotti, L.; Mongodi, S.; Tavazzi, G.; Marseglia, G.; Licari, A.; Brambilla, I.; Daniela, B.; Antonella, B.; Patrizia, C.; Giulia, C.; Giuditta, C.; Marta, C.; D'Alterio, Rossana; Milena, F.; Bianca, M.; Roberta, M.; Enza, M.; Stefania, P.; Maurizio, P.; Elena, P.; Francesca, R.; Antonella, S.; Maurizio, Z.; Marone, P.; Guy, A.; Laura, B.; Ermanna, C.; Giuliana, C.; Luca, D.; Gabriella, F.; Gabriella, G.; Alessia, G.; Viviana, L.; Claudia, L.; Valentina, M.; Simona, P.; Marta, P.; Alice, B.; Giacomo, C.; Irene, C.; Alfonso, C.; Raffella, D. M.; Annapia, D. N.; Alessandro, F.; Guglielmo, F.; Loretta, F.; Federica, G.; Albertini, Alessandra; Federica, N.; Giacomo, R.; Beatrice, R.; Maria, S. I.; Monica, T.; Edoardo, V. N.; Calvi, M.; Tizzoni, M.; Nicora, C.; Triarico, A.; Petronella, V.; Marena, C.; Muzzi, A.; Cutti, S.; Novelli, V.; Lago, P.; Comandatore, F.; Gaiarsa, S.; Rettani, M.; Bandi, C.; Ferrari, A.
Lack of SARS-CoV-2 RNA environmental contamination in a tertiary referral hospital for infectious diseases in Northern Italy 1-gen-2020 Colaneri, M.; Seminari, E.; Piralla, A.; Zuccaro, V.; Di Filippo, A.; Baldanti, F.; Bruno, R.; Mondelli, M. U.; Brunetti, E.; Di Matteo, A.; Maiocchi, L.; Pagnucco, L.; Mariani, B.; Ludovisi, S.; Lissandrin, R.; Parisi, A.; Sacchi, P.; Patruno, S. F. A.; Michelone, G.; Gulminetti, R.; Zanaboni, D.; Novati, S.; Maserati, R.; Orsolini, P.; Vecchia, M.; Sciarra, M.; Asperges, E.; Sambo, M.; Biscarini, S.; Lupi, M.; Roda, S.; Chiara Pieri, T.; Gallazzi, I.; Sachs, M.; Valsecchi, P.; Perlini, S.; Alfano, C.; Bonzano, M.; Briganti, F.; Crescenzi, G.; Giulia Falchi, A.; Guarnone, R.; Guglielmana, B.; Maggi, E.; Martino, I.; Pettenazza, P.; Pioli di Marco, S.; Quaglia, F.; Sabena, A.; Salinaro, F.; Speciale, F.; Zunino, I.; De Lorenzo, M.; Secco, G.; Dimitry, L.; Cappa, G.; Maisak, I.; Chiodi, B.; Sciarrini, M.; Barcella, B.; Resta, F.; Moroni, L.; Vezzoni, G.; Scattaglia, L.; Boscolo, E.; Zattera, C.; Michele Fidel, T.; Vincenzo, C.; Vignaroli, D.; Bazzini, M.; Iotti, G.; Mojoli, F.; Belliato, M.; Perotti, L.; Mongodi, S.; Tavazzi, G.; Marseglia, G.; Licari, A.; Brambilla, I.; Daniela, B.; Antonella, B.; Patrizia, C.; Giulia, C.; Giuditta, C.; Marta, C.; D'Alterio, Rossana; Milena, F.; Bianca, M.; Roberta, M.; Enza, M.; Stefania, P.; Maurizio, P.; Elena, P.; Antonio, P.; Francesca, R.; Antonella, S.; Maurizio, Z.; Guy, A.; Laura, B.; Ermanna, C.; Giuliana, C.; Luca, D.; Gabriella, F.; Gabriella, G.; Alessia, G.; Viviana, L.; Meisina, Claudia; Valentina, M.; Simona, P.; Marta, P.; Alice, B.; Giacomo, C.; Irene, C.; Alfonso, C.; Di Martino, R.; Di Napoli, A.; Alessandro, F.; Guglielmo, F.; Loretta, F.; Federica, G.; Albertini, Alessandra; Federica, N.; Giacomo, R.; Beatrice, R.; Maria, S. I.; Monica, T.; Nepita Edoardo, V.; Calvi, M.; Tizzoni, M.; Nicora, C.; Triarico, A.; Petronella, V.; Marena, C.; Muzzi, A.; Lago, P.; Comandatore, F.; Bissignandi, G.; Gaiarsa, S.; Rettani, M.; Bandi, C.
Phylogenomics reveals that asaia symbionts from insects underwent convergent genome reduction, preserving an insecticide-degrading gene 1-gen-2021 Comandatore, F.; Damiani, C.; Cappelli, A.; Ribolla, P. E. M.; Gasperi, G.; Gradoni, F.; Capelli, G.; Piazza, A.; Montarsi, F.; Mancini, M. V.; Rossi, P.; Ricci, I.; Bandi, C.; Favia, G.
Modeling the Life Cycle of the Intramitochondrial Bacterium "Candidatus Midichloria mitochondrii" Using Electron Microscopy Data 1-gen-2021 Comandatore, F.; Radaelli, G.; Montante, S.; Sacchi, L.; Clementi, E.; Epis, S.; Cafiso, A.; Serra, V.; Pajoro, M.; Di Carlo, D.; Floriano, A. M.; Stavru, F.; Bandi, C.; Sassera, D.
A dual endosymbiosis supports nutritional adaptation to hematophagy in the invasive tick Hyalomma marginatum 1-gen-2021 Buysse, M.; Floriano, A. M.; Gottlieb, Y.; Nardi, T.; Comandatore, F.; Olivieri, E.; Giannetto, A.; Palomar, A. M.; Makepeace, B. L.; Bazzocchi, C.; Cafiso, A.; Sassera, D.; Duron, O.
Mosquito Trilogy: Microbiota, Immunity and Pathogens, and Their Implications for the Control of Disease Transmission 1-gen-2021 Gabrieli, P.; Caccia, S.; Varotto-Boccazzi, I.; Arnoldi, I.; Barbieri, G.; Comandatore, F.; Epis, S.
EBV DNA increase in COVID-19 patients with impaired lymphocyte subpopulation count 1-gen-2021 Paolucci, S.; Cassaniti, I.; Novazzi, F.; Fiorina, L.; Piralla, A.; Comolli, G.; Bruno, R.; Maserati, R.; Gulminetti, R.; Novati, S.; Mojoli, F.; Baldanti, F.; Bruno, R.; Mondelli, M.; Brunetti, E.; Di Matteo, A.; Seminari, E.; Maiocchi, L.; Zuccaro, V.; Pagnucco, L.; Mariani, B.; Ludovisi, S.; Lissandrin, R.; Parisi, A.; Sacchi, P.; Patruno, S. F. A.; Michelone, G.; Gulminetti, R.; Zanaboni, D.; Novati, S.; Maserati, R.; Orsolini, P.; Vecchia, M.; Sciarra, M.; Asperges, E.; Colaneri, M.; Di Filippo, A.; Sambo, M.; Biscarini, S.; Lupi, M.; Roda, S.; Pieri, T. C.; Gallazzi, I.; Sachs, M.; Valsecchi, P.; Perlini, S.; Alfano, C.; Bonzano, M.; Briganti, F.; Crescenzi, G.; Falchi, A. G.; Guarnone, R.; Guglielmana, B.; Maggi, E.; Martino, I.; Pettenazza, P.; Pioli di Marco, S.; Quaglia, F.; Sabena, A.; Salinaro, F.; Speciale, F.; Zunino, I.; De Lorenzo, M.; Secco, G.; Dimitry, L.; Cappa, G.; Maisak, I.; Chiodi, B.; Sciarrini, M.; Barcella, B.; Resta, F.; Moroni, L.; Vezzoni, G.; Scattaglia, L.; Boscolo, E.; Zattera, C.; Tassi, M. F.; Capozza, V.; Vignaroli, D.; Bazzini, M.; Iotti, G.; Mojoli, F.; Belliato, M.; Perotti, L.; Mongodi, S.; Tavazzi, G.; Marseglia, G.; Licari, A.; Brambilla, I.; Barbarini, D.; Bruno, A.; Cambieri, P.; Campanini, G.; Cavanna, C.; Comolli, G.; Corbella, M.; Daturi, R.; Furione, M.; Marone, P.; Monzillo, E.; Paolucci, S.; Parea, M.; Percivalle, E.; Piralla, A.; Rovida, F.; Sarasini, A.; Zavattoni, M.; Adzasehoun, G.; Ardizzone, M.; Bellotti, L.; Brunco, V.; Cabano, E.; Casali, G.; Capella, L.; Devitis, D.; Dossena, L.; Frisco, G.; Garbagnoli, G.; Gardellini, F.; Girello, A.; Guerrizio, A.; Landini, V.; Lucchelli, C.; Maliardi, V.; Piemontese, P.; Pezzaia, S.; Premoli, M.; Rebuffa, C.; Zanello, C.; Bagnarino, J.; Bergami, F.; Bonetti, A.; Caneva, G.; Cassaniti, I.; Corcione, A.; Di Martino, R.; Di Napoli, A.; Ferrari, A.; Ferrari, G.; Fiorina, L.; Gallone, A.; Giardina, F.; Girardi, A.; Mercato, A.; Merla, C.; Novazzi, F.; Ratano, G.; Rossi, B.; Saveriaempillai, G.; Sciabica, I. M.; Tallarita, M.; Vecchio Nepita, E.; Vitali, J.; Cerino, A.; Varchetta, S.; Oliviero, B.; Mantovani, S.; Mele, D.; Calvi, M.; Tizzoni, M.; Nicora, C.; Triarico, A.; Petronella, V.; Marena, C.; Muzzi, A.; Lago, P.; Cutti, S.; Novelli, V.; Comandatore, F.; Batistibiffignandi, G.; Gaiarsa, S.; Rettani, M.; Bandi, C.
Antimicrobial Susceptibility, Virulence, and Genomic Features of a Hypervirulent Serotype K2, ST65 Klebsiella pneumoniae Causing Meningitis in Italy 1-gen-2022 Piazza, Aurora; Perini, Matteo; Mauri, Carola; Comandatore, Francesco; Meroni, Elisa; Luzzaro, Francesco; Principe, Luigi
A large-scale genomic snapshot of Klebsiella spp. isolates in Northern Italy reveals limited transmission between clinical and non-clinical settings 1-gen-2022 Thorpe, Harry A; Booton, Ross; Kallonen, Teemu; Gibbon, Marjorie J; Couto, Natacha; Passet, Virginie; López-Fernández, Sebastián; Rodrigues, Carla; Matthews, Louise; Mitchell, Sonia; Reeve, Richard; David, Sophia; Merla, Cristina; Corbella, Marta; Ferrari, Carolina; Comandatore, Francesco; Marone, Piero; Brisse, Sylvain; Sassera, Davide; Corander, Jukka; Feil, Edward J
The Bio-Diversity and the Role of Gut Microbiota in Postmenopausal Women with Luminal Breast Cancer Treated with Aromatase Inhibitors: An Observational Cohort Study 1-gen-2022 Lasagna, Angioletta; De Amici, Mara; Rossi, Chiara; Zuccaro, Valentina; Corbella, Marta; Petazzoni, Greta; Comandatore, Francesco; Sacchi, Lucia; Testa, Giorgia; Ferraris, Elisa; Rizzo, Gianpiero; Tancredi, Richard; Ferrari, Alessandra; Lucioni, Marco; Sacchi, Paolo; Bruno, Raffaele; Pedrazzoli, Paolo
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