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Comparative analysis of the two Acinetobacter baumannii multilocus sequence typing (MLST) schemes 1-gen-2019 Gaiarsa, S.; BATISTI BIFFIGNANDI, Gherard; Esposito, E. P.; Castelli, M.; Jolley, K. A.; Brisse, S.; Sassera, D.; Zarrilli, R.
Authors' response: COVID-19: how accurate are seroprevalence studies? 1-gen-2020 Cassaniti, I.; Percivalle, E.; Sarasini, A.; Cambie, G.; Batisti Biffignandi, G.; Cereda, D.; Baldanti, F.
Extensively drug-resistant Proteus mirabilis strain harbouring blaNDM-1, blaVEB-6 and blaTEM-92 genes isolated from urine in Italy 1-gen-2021 Merla, C.; Batisti Biffignandi, G.; Corbella, M.; Ferrari, C.; Di Napoli, A.; Scaltriti, E.; Mariani, B.; Marone, P.; Sassera, D.; Cambieri, P.
MeltingPlot, a user-friendly online tool for epidemiological investigation using High Resolution Melting data 1-gen-2021 Perini, Matteo; Batisti Biffignandi, Gherard; Di Carlo, Domenico; Pasala, Ajay Ratan; Piazza, Aurora; Panelli, Simona; Zuccotti, Gian Vincenzo; Comandatore, Francesco
Comparative analysis of SARS-CoV-2 quasispecies in the upper and lower respiratory tract shows an ongoing evolution in the spike cleavage site 1-gen-2022 Gaiarsa, Stefano; Giardina, Federica; Batisti Biffignandi, Gherard; Ferrari, Guglielmo; Piazza, Aurora; Tallarita, Monica; Novazzi, Federica; Bandi, Claudio; Paolucci, Stefania; Rovida, Francesca; Campanini, Giulia; Piralla, Antonio; Baldanti, Fausto
Spread of multiple SARS-CoV-2 lineages April-August 2020 anticipated the second pandemic wave in Lombardy (Italy) 1-gen-2022 Tallarita, Monica; Giardina, Federica; Novazzi, Federica; Gaiarsa, Stefano; Batisti Biffignandi, Gherard; Paolucci, Stefania; Rovida, Francesca; Piralla, Antonio; Baldanti, Fausto
Genomic Characterization of an O101:H9-ST167 NDM-5-Producing Escherichia coli Strain from a Kitten in Italy 1-gen-2022 Batisti Biffignandi, Gherard; Piazza, Aurora; Marchesini, Federica; Prati, Paola; Mercato, Alessandra; Abualshaar, Aseel; Andreoli, Giuseppina; Sassera, Davide; Migliavacca, Roberta
The evolution of intramitochondriality in Midichloria bacteria 1-gen-2023 Floriano, Anna Maria; Batisti Biffignandi, Gherard; Castelli, Michele; Olivieri, Emanuela; Clementi, Emanuela; Comandatore, Francesco; Rinaldi, Laura; Opara, Maxwell; Plantard, Olivier; Palomar, Ana M.; Noël, Valérie; Vijay, Amrita; Lo, Nathan; Makepeace, Benjamin L.; Duron, Olivier; Jex, Aaron; Guy, Lionel; Sassera, Davide
Combining Genome Surveillance and Metadata To Characterize the Diversity of Staphylococcus aureus Circulating in an Italian Hospital over a 9-Year Period 1-gen-2023 Postiglione, U.; Batisti Biffignandi, G.; Corbella, M.; Merla, C.; Olivieri, E.; Petazzoni, G.; Feil, E. J.; Bandi, C.; Cambieri, P.; Gaiarsa, S.; Brilli, M.; Sassera, D.
P-DOR, an easy-to-use pipeline to reconstruct bacterial outbreaks using genomics 1-gen-2023 Batisti Biffignandi, Gherard; Bellinzona, Greta; Petazzoni, Greta; Sassera, Davide; Zuccotti, Gian Vincenzo; Bandi, Claudio; Baldanti, Fausto; Comandatore, Francesco; Gaiarsa, Stefano
Antigen discovery by bioinformatics analysis and peptide microarray for the diagnosis of cystic echinococcosis 1-gen-2023 Batisti Biffignandi, Gherard; Vola, Ambra; Sassera, Davide; Najafi-Fard, Saeid; Gomez Morales, Maria Angeles; Brunetti, Enrico; Teggi, Antonella; Goletti, Delia; Petrone, Linda; Tamarozzi, Francesca
Gestione delle infezioni batteriche nosocomiali attraverso l'integrazione di bioinformatica, epidemiologia genomica e apprendimento automatico 30-mar-2023 BATISTI BIFFIGNANDI, Gherard
High-throughput screening of pathogens in Ixodes ricinus removed from hosts in Lombardy, northern Italy 1-gen-2024 Melis, Sophie; Batisti Biffignandi, Gherard; Olivieri, Emanuela; Galon, Clémence; Vicari, Nadia; Prati, Paola; Moutailler, Sara; Sassera, Davide; Castelli, Michele
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