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The Subtle Trade-Off between Evolutionary and Energetic Constraints in Protein-Protein Interactions 1-gen-2019 Marchetti, Filippo; Capelli, R.; Rizzato, F.; Laio, A.; Colombo, G.
The Answer Lies in the Energy: How Simple Atomistic Molecular Dynamics Simulations May Hold the Key to Epitope Prediction on the Fully Glycosylated SARS-CoV-2 Spike Protein 1-gen-2020 Serapian, Stefano A.; Marchetti, Filippo; Triveri, Alice; Morra, Giulia; Meli, Massimiliano; Moroni, Elisabetta; Sautto, Giuseppe A.; Rasola, Andrea; Colombo, Giorgio
Exploiting the folding and degradation machineries to target undruggable proteins: What can the computational approach tell us? 1-gen-2021 Serapian, Stefano A; Castelli, Matteo; Marchetti, Filippo; Triveri, Alice; Colombo, Giorgio
Machine Learning Prediction of Allosteric Drug Activity from Molecular Dynamics 1-gen-2021 Marchetti, F.; Moroni, E.; Pandini, A.; Colombo, G.
SARS-CoV-2 Spike Protein Mutations and Escape from Antibodies: A Computational Model of Epitope Loss in Variants of Concern 1-gen-2021 Triveri, A.; Serapian, S. A.; Marchetti, F.; Doria, F.; Pavoni, S.; Cinquini, F.; Moroni, E.; Rasola, A.; Frigerio, F.; Colombo, G.
Protein Allostery and Ligand Design: Computational Design Meets Experiments to Discover Novel Chemical Probes 1-gen-2022 Triveri, Alice; Sanchez-Martin, Carlos; Torielli, Luca; Serapian, Stefano A; Marchetti, Filippo; D'Acerno, Giovanni; Pirota, Valentina; Castelli, Matteo; Moroni, Elisabetta; Ferraro, Mariarosaria; Quadrelli, Paolo; Rasola, Andrea; Colombo, Giorgio
Conformational Behavior of SARS-Cov-2 Spike Protein Variants: Evolutionary Jumps in Sequence Reverberate in Structural Dynamic Differences 1-gen-2023 Triveri, Alice; Casali, Emanuele; Frasnetti, Elena; Doria, Filippo; Frigerio, Francesco; Cinquini, Fabrizio; Pavoni, Silvia; Moroni, Elisabetta; Marchetti, Filippo; Serapian, Stefano A.; Colombo, Giorgio
Decrypting Allostery in Membrane-Bound K-Ras4B Using Complementary In Silico Approaches Based on Unbiased Molecular Dynamics Simulations 1-gen-2023 Castelli, Matteo; Marchetti, Filippo; Osuna, Sílvia; Oliveira, A. Sofia F.; Mulholland, Adrian J.; Serapian, Stefano A.; Colombo, Giorgio
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