Ceratitis capitata, dittero invasivo e altamente dannoso per la frutticoltura in diversi paesi, è considerata la specie modello per lo sviluppo di programmi di controllo biologico. La quantità di sequenze della specie attualmente disponibili in banca dati è limitata, nonostante siano state condotte, nelle due ultime decadi, numerose ricerche genetiche e molecolari, indirizzate principalmente allo studio delle popolazioni naturali ed alla costruzione di mappe geniche e cromosomiche. Allo scopo di colmare le lacune nel campo delle conoscenze molecolari su questa specie, è stato scelto un approccio basato su EST (Expressed Sequence Tag) che offre dettagliate informazioni su sequenze correlate a diversi sistemi fisiologici di C. capitata. Dalle due librerie (di embrioni e di teste) sono stati ottenuti più di 21.000 EST di alta qualità e dall‟analisi di clustering sono derivate circa 12.000 sequenze uniche (trascritti). Queste sequenze assemblate rappresentano una notevole risorsa per lo studio di processi biologici e di funzioni molecolari. Di particolare interesse per programmi di controllo biologico sono le sequenze che condividono omologia con geni di Drosophila melanogaster coinvolti nella determinazione del sesso, nei meccanismi legati all‟olfatto e nel comportamento riproduttivo. Le sequenze ottenute in questo studio rappresentano la prima banca dati di geni espressi in una specie di ditteri tefritidi di importanza agraria. Questo database costituisce una risorsa essenziale per sviluppare ricerche su argomenti riguardanti la biologia di C. capitata e di altre specie correlate. Rappresenta inoltre un potente mezzo per supportare l‟annotazione delle sequenze del genoma completo.

Identificazione di geni e genomica funzionale in Ceratitis capitata (Medfly) (Diptera, Tephritidae)

GOMULSKI, LUDVIK;SCOLARI, FRANCESCA;GABRIELI, PAOLO;MALACRIDA, ANNA RODOLFA;GASPERI, GIULIANO
2008-01-01

Abstract

Ceratitis capitata, dittero invasivo e altamente dannoso per la frutticoltura in diversi paesi, è considerata la specie modello per lo sviluppo di programmi di controllo biologico. La quantità di sequenze della specie attualmente disponibili in banca dati è limitata, nonostante siano state condotte, nelle due ultime decadi, numerose ricerche genetiche e molecolari, indirizzate principalmente allo studio delle popolazioni naturali ed alla costruzione di mappe geniche e cromosomiche. Allo scopo di colmare le lacune nel campo delle conoscenze molecolari su questa specie, è stato scelto un approccio basato su EST (Expressed Sequence Tag) che offre dettagliate informazioni su sequenze correlate a diversi sistemi fisiologici di C. capitata. Dalle due librerie (di embrioni e di teste) sono stati ottenuti più di 21.000 EST di alta qualità e dall‟analisi di clustering sono derivate circa 12.000 sequenze uniche (trascritti). Queste sequenze assemblate rappresentano una notevole risorsa per lo studio di processi biologici e di funzioni molecolari. Di particolare interesse per programmi di controllo biologico sono le sequenze che condividono omologia con geni di Drosophila melanogaster coinvolti nella determinazione del sesso, nei meccanismi legati all‟olfatto e nel comportamento riproduttivo. Le sequenze ottenute in questo studio rappresentano la prima banca dati di geni espressi in una specie di ditteri tefritidi di importanza agraria. Questo database costituisce una risorsa essenziale per sviluppare ricerche su argomenti riguardanti la biologia di C. capitata e di altre specie correlate. Rappresenta inoltre un potente mezzo per supportare l‟annotazione delle sequenze del genoma completo.
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