The impact of viral mutations on recognition by SARS-CoV-2 specific T cells

Silva, De; ; Liu, T. I.; ; Lindsey, G.; ; Dong, B. B.; ; Moore, D.; ; Hsu, S. C.; ; Shah, N. S.; ; Wellington, D.; ; Mentzer, D.; ; Angyal, A. J.; ; Brown, A.; ; Parker, R.; ; Ying, M. D.; ; Yao, Z.; ; Turtle, X.; ; Dunachie, L.; ; Aanensen, S.; ; Abudahab, D. M.; ; Adams, K.; ; Adams, H.; ; Afifi, A.; ; Aggarwal, S.; ; Ahmad, D.; ; Aigrain, S. S. Y.; ; Alcolea-Medina, L.; ; Alikhan, A.; ; Allara, N. -F.; ; Amato, E.; ; Annett, R.; ; Aplin, T.; ; Ariani, S.; ; Asad, C. V.; ; Ash, H.; ; Ashfield, A.; ; Ashford, P.; ; Atkinson, F.; ; Attwood, L.; ; Auckland, S. W.; ; Aydin, C.; ; Baker, A.; ; Baker, D. J.; ; Balcazar, P.; ; Ball, C. E.; ; Barrett, J.; ; Barrow, J. C.; ; Barton, M.; ; Bashton, E.; ; Bassett, M.; ; Batra, A. R.; ; Baxter, R.; ; Bayzid, C.; ; Beaver, N.; ; Beckett, C.; ; Beckwith, A. H.; ; Bedford, S. M.; ; Beer, L.; ; Beggs, R.; ; Bellis, A.; ; Berry, K. L.; ; Bertolusso, L.; ; Best, B.; ; Betteridge, A.; ; Bibby, E.; ; Bicknell, D.; ; Binns, K.; ; Birchley, D.; ; Bird, A.; ; Bishop, P. W.; ; Blacow, C.; ; Blakey, R.; ; Blane, V.; ; Bolt, B.; ; Bonfield, F.; ; Bonner, J.; ; Bonsall, S.; ; Boswell, D.; ; Bosworth, T.; ; Bourgeois, A.; ; Boyd, Y.; ; Bradley, O.; ; Breen, D. T.; ; Bresner, C.; ; Breuer, C.; ; Bridgett, J.; ; Bronner, S.; ; Brooks, I. F.; ; Broos, E.; ; Brown, A.; ; Bucca, J. R.; ; Buchan, G.; ; Buck, S. L.; ; Bull, D.; ; Burns, M.; ; Burton-Fanning, P. J.; ; Byaruhanga, S.; ; Byott, T.; ; Campbell, M.; ; Carabelli, S.; ; Cargill, A. M.; ; Carlile, J. S.; ; Carvalho, M.; ; Casey, S. F.; ; Castigador, A.; ; Catalan, A.; ; Chalker, J.; ; Chaloner, V.; ; Chand, N. J.; ; Chappell, M.; ; Charalampous, J. G.; ; Chatterton, T.; ; Chaudhry, W.; ; Churcher, Y.; ; Clark, C. M.; ; Clarke, G.; ; Cogger, P.; ; Cole, B. J.; ; Collins, K.; ; Colquhoun, J.; ; Connor, R.; ; Cook, T. R.; ; Coombes, K. F.; ; Corden, J.; ; Cormie, S.; ; Cortes, C.; ; Cotic, N.; ; Cotton, M.; ; Cottrell, S.; ; Coupland, S.; ; Cox, L.; ; Cox, M.; ; Craine, A.; ; Crawford, N.; ; Cross, L.; ; Crown, A.; ; Crudgington, M. R.; ; Cumley, D.; ; Curran, N.; ; Curran, T.; ; da Silva Filipe, M. D.; ; Dabrera, A.; ; Darby, G.; ; Davidson, A. C.; ; Davies, R. K.; ; Davies, A.; ; Davis, R. M.; ; de Angelis, T.; ; De Lacy, D.; ; de Oliveira Martins, E.; ; Debebe, L.; ; Denton-Smith, J.; ; Dervisevic, R.; ; Dewar, S.; ; Dey, R.; ; Dias, J.; ; Dobie, J.; ; Dorman, D.; ; Downing, M. J.; ; Driscoll, F.; ; du Plessis, M.; ; Duckworth, L.; ; Durham, N.; ; Eastick, J.; ; Easton, K.; ; Eccles, L. J.; ; Edgeworth, R.; ; Edwards, J.; ; El Bouzidi, S.; ; Eldirdiri, K.; ; Ellaby, S.; ; Elliott, N.; ; Eltringham, S.; ; Ensell, G.; ; Erkiert, L.; ; Zamudio, M. J.; ; Essex, M. E.; ; Evans, S.; ; Evans, J. M.; ; Everson, C.; ; Fairley, W.; ; Fallon, D. J.; ; Fanaie, K.; ; Farr, A.; ; Fearn, B. W.; ; Feltwell, C.; ; Ferguson, T.; ; Fina, L.; ; Flaviani, L.; ; Fleming, F.; ; Forrest, V. M.; ; Foster-Nyarko, S.; ; Foulkes, E.; ; Foulser, B. H.; ; Fragakis, L.; ; Frampton, M.; ; Francois, D.; ; Fraser, S.; ; Freeman, C.; ; Fryer, T. M.; ; Fuchs, H.; ; Fuller, M.; ; Gajee, W.; ; Galai, K.; ; Gallagher, K.; ; Gallagher, A.; ; Gallagher, E.; ; Gallis, M. D.; ; Gaskin, M.; ; Gatica-Wilcox, A.; ; Geidelberg, B.; ; Gemmell, L.; ; Georgana, M.; ; George, I.; ; Gifford, R. P.; ; Gilbert, L.; ; Girgis, L.; ; Glaysher, S. T.; ; Goldstein, S.; ; Golubchik, E. J.; ; Gomes, T.; ; Gonçalves, A. N.; ; Goodfellow, S.; ; Goodwin, I. G.; ; Goudarzi, S.; ; Gourtovaia, S.; ; Graham, M.; ; Graham, C.; ; Grant, L.; ; Green, P. R.; ; Green, L. R.; ; Greenaway, A.; ; Gregory, J.; ; Guest, R.; ; Gunson, M.; ; Gupta, R. N.; ; Gutierrez, R. K.; ; Haldenby, B.; ; Hamilton, S. T.; ; Hansford, W. L.; ; Haque, S. E.; ; Harris, T.; ; Harrison, K. A.; ; Harrison, I.; ; Hart, E. M.; ; Hartley, J.; ; Harvey, J. A.; ; Harvey, W. T.; ; Hassan-Ibrahim, M.; ; Heaney, M. O.; ; Helmer, J.; ; Henderson, T.; ; Hesketh, J. H.; ; Hey, A. R.; ; Heyburn, J.; ; Higginson, D.; ; Hill, E. E.; ; Hill, V.; ; Hilson, J. D.; ; Hilvers, R. A.; ; Holden, E.; ; Hollis, M. T. G.; ; Holmes, A.; ; Holmes, C. W.; ; Holmes, N.; ; Hopes, A. H.; ; Hornsby, R.; ; Hosmillo, H. R.; ; Houlihan, M.; ; Howson-Wells, C.; ; Hubb, H. C.; ; Huckson, J.; ; Hughes, H.; ; Hughes, W.; ; Hughes, J.; ; Hutchings, M.; ; Idle, S.; ; Illingworth, G.; ; Impey, C. J.; ; Irish-Tavares, R.; ; Iturriza-Gomara, D.; ; Izuagbe, M.; ; Jackson, R.; ; Jackson, C.; ; Jackson, B.; ; Jackson, L. M.; ; Jackson, K. A.; ; Jahun, D. K.; ; James, A. S.; ; James, V.; ; Jeanes, K.; ; Jeffries, C.; ; Jeremiah, A. R.; ; Jermy, S.; ; John, A.; ; Johnson, M.; ; Johnson, R.; ; Johnston, K.; ; Jones, I.; ; Jones, O.; ; Jones, S.; ; Jones, H.; ; Jones, C. R.; ; Joseph, N.; ; Judges, A.; ; Kay, S.; ; Kay, G. L.; ; Keatley, S.; ; Keeley, J. -P.; ; Kenyon, A. J.; ; Kermack, A.; ; Khakh, L. M.; ; Kidd, M.; ; Kimuli, S. P.; ; Kirk, M.; ; Kitchen, S.; ; Kitchman, C.; ; Knight, K.; ; Koshy, B. A.; ; Kraemer, C.; ; Kumziene-Summerhayes, M. U. G.; ; Kwiatkowski, S.; ; Lackenby, D.; ; Laing, A.; ; Lampejo, K. G.; ; Langford, T.; ; Lavin, C. F.; ; Lawton, D.; ; Lee, A. I.; ; Lee, J.; ; Lensing, D.; ; Leonard, S. V.; ; Levett, S.; ; Le-Viet, L. J.; ; Lewis, T.; ; Lewis, J.; ; Liddle, K.; ; Liggett, J.; ; Lillie, S.; ; Lister, P. J.; ; Livett, M. M.; ; Lo, R.; ; Loman, S.; ; Loose, N. J.; ; Louka, M. W.; ; Loveson, S. F.; ; Lowdon, K. F.; ; Lowe, S.; ; Lowe, H.; ; Lucaci, H. L.; ; Ludden, A. O.; ; Lynch, C.; ; Lyons, J.; ; Lythgoe, R. A.; ; Machin, K.; ; MacIntyre-Cockett, N. W.; ; Mack, G.; ; Macklin, A.; ; Maclean, B.; ; Macnaughton, A.; ; Madona, E.; ; Maes, P.; ; Maftei, M.; ; Mahanama, L.; ; Mahungu, A. I. K.; ; Mair, T. W.; ; Maksimovic, D.; ; Malone, J.; ; Maloney, C. S.; ; Manesis, D.; ; Manley, N.; ; Mantzouratou, R.; ; Marchbank, A.; ; Mariappan, A.; ; Martincorena, A.; ; Martinez Nunez, I.; ; Mather, R. T.; ; Maxwell, A. E.; ; Mayhew, P.; ; Mbisa, M.; ; McCann, T.; ; McCarthy, C. M.; ; McCluggage, S. A.; ; McClure, K.; ; McCrone, P. C.; ; McHugh, J. T.; ; McKenna, M. P.; ; McKerr, J. P.; ; McManus, C.; ; McMurray, G. M.; ; McMurray, C. L.; ; McNally, C.; ; Meadows, A.; ; Medd, L.; ; Megram, N.; ; Menegazzo, O.; ; Merrick, M.; ; Michell, I.; ; Michelsen, S. L.; ; Mirfenderesky, M. L.; ; Mirza, M.; ; Miskelly, J.; ; Moles-Garcia, J.; ; Moll, E.; ; Molnar, R. J.; ; Monahan, Z.; ; Mondani, I. M.; ; Mookerjee, M.; ; Moore, S.; ; Moore, C.; ; Moore, J.; ; Moore, N.; ; Morcrette, C.; ; Morgan, H.; ; Morgan, S.; ; Mori, M.; ; Morriss, M.; ; Moses, A.; ; Mower, S.; ; Muir, C.; ; Mukaddas, P.; ; Munemo, A.; ; Munn, F.; ; Murray, R.; ; Murray, A.; ; Murray, L. J.; ; Mutingwende, D. R.; ; Myers, M.; ; Nastouli, R.; ; Nebbia, E.; ; Nelson, G.; ; Nelson, A.; ; Nicholls, C.; ; Nichols, S.; ; Nicodemi, J.; ; Nomikou, R.; ; O'Grady, K.; ; O'Brien, J.; ; Odedra, S.; ; Ohemeng-Kumi, M.; ; Oliver, N.; ; Orton, K.; ; Osman, R. J.; ; xeine O'Toole; Pacchiarini, H.; ; Padgett, N.; ; Page, D.; ; Park, A. J.; ; Park, E. J.; ; Parmar, N. R.; ; Partridge, S.; ; Pascall, D. G.; ; Patel, D.; ; Patel, A.; ; Paterson, B.; ; Payne, S.; ; Peacock, B. A. I.; ; Pearson, S. J.; ; Pelosi, C.; ; Percival, E.; ; Perkins, B.; ; Perry, J.; ; Pinckert, M.; ; Platt, M. L.; ; Podplomyk, S.; ; Pohare, O.; ; Pond, M.; ; Pope, M.; ; Poplawski, C. F.; ; Powell, R.; ; Poyner, J.; ; Prestwood, J.; ; Price, L.; ; Price, A.; ; Prieto, J. R.; ; Pritchard, J. A.; ; Prosolek, D. T.; ; Pugh, S. J.; ; Pusok, G.; ; Pybus, M.; ; Pymont, O. G.; ; Quail, H. M.; ; Quick, M. A.; ; Radulescu, J.; ; Raghwani, C.; ; Ragonnet-Cronin, J.; ; Rainbow, M.; ; Rajan, L.; ; Rajatileka, D.; ; Ramadan, S.; ; Rambaut, N. A.; ; Ramble, A.; ; Randell, J.; ; Randell, P. A.; ; Ratcliffe, P.; ; Raviprakash, L.; ; Raza, V.; ; Redshaw, M.; ; Rey, N. M.; ; Reynolds, S.; ; Richter, N.; ; Robertson, A.; ; Robinson, D. L.; ; Robson, E.; ; Rogan, S. C.; ; Rooke, F.; ; Rowe, S.; ; Roy, W.; ; Rudder, S.; ; Ruis, S.; ; Rushton, C.; ; Ryan, S.; ; Saeed, F.; ; Samaraweera, K.; ; Sambles, B.; ; Sanderson, C. M.; ; Sanderson, R.; ; Sang, T.; ; Sass, F.; ; Scher, T.; ; Scott, E.; ; Scott, G.; ; Sehmi, C.; ; Shaaban, J.; ; Shah, S.; ; Shaw, D.; ; Shelest, J.; ; Shepherd, E.; ; Sheridan, J. G.; ; Sheriff, L. A.; ; Shirley, N.; ; Sillitoe, L.; ; Silviera, J.; ; Simpson, S.; ; Singh, D. A.; ; Singleton, A.; ; Skvortsov, D.; ; Sloan, T.; ; Sluga, T. J.; ; Smith, G.; ; Smith, K.; ; Smith, K. S.; ; Smith, P.; ; Smith, D. L.; ; Smith, L.; ; Smith, C. P.; ; Smollett, N.; ; Snell, K. L.; ; Somassa, L. B.; ; Southgate, T.; ; Spellman, J.; ; Spencer Chapman, K.; ; Spurgin, M. H.; ; Spyer, L. G.; ; Stanley, M. J.; ; Stanley, R.; ; Stanton, W.; ; Starinskij, T. D.; ; Stockton, I.; ; Stonehouse, J.; ; Storey, S.; ; Studholme, N.; ; Sudhanva, D. J.; ; Swindells, M.; ; Taha, E.; ; Tan, Y.; ; Tang, N. K.; ; Tang, J. W.; ; Taylor, M.; ; Taylor, B. E. W.; ; Taylor, J. F.; ; Temperton, S.; ; Templeton, B.; ; Thomas, K. E.; ; Thomson, C.; ; Thomson, L.; ; Thornton, E. C.; ; Thurston, A.; ; Todd, S. A. J.; ; Tomb, J. A.; ; Tong, R.; ; Tonkin-Hill, L.; ; Torok, G.; ; Tovar-Corona, M. E.; ; Trebes, J. M.; ; Trotter, A.; ; Tsatsani, A. J.; ; Turnbull, I.; ; Twohig, R.; ; Umpleby, K. A.; ; Underwood, H.; ; Vamos, A. P.; ; Vasylyeva, E. E.; ; Vattipally, T. I.; ; Vernet, S.; ; Vipond, G.; ; Volz, B. B.; ; Walsh, E. M.; ; Wang, S.; ; Warne, D.; ; Warwick-Dugdale, B.; ; Wastnedge, J.; ; Watkins, E.; ; Watson, J.; ; Waugh, L. K.; ; Webster, S.; ; Weldon, H. J.; ; Westwick, D.; ; Whalley, E.; ; Wheeler, T.; ; Whitehead, H.; ; Whiteley, M.; ; Whitwham, M.; ; Wierzbicki, A.; ; Willford, C.; ; Williams, N. J.; ; Williams, L. -A.; ; Williams, R.; ; Williams, C.; ; Williams, C.; ; Williams, C. A.; ; Williams, R. J.; ; Williams, T.; ; Williamson, C.; ; Wilson-Davies, K. A.; ; Witele, E.; ; Withell, E.; ; Witney, K. T.; ; Wolverson, A. A.; ; Wong, P.; ; Workman, N.; ; Wright, T.; ; Wright, V.; ; Wyatt, D. W.; ; Wyllie, T.; ; Xu-McCrae, S.; ; Yavus, L.; ; Yaze, M.; ; Yeats, G.; ; Yebra, C. A.; ; Yew, G.; ; Young, W. C.; ; Young, G. R.; ; Zarebski, J.; ; Zhang, A. E.; ; Maini, P.; ; Ogg, M. K.; ; Knight, G.; ; Baillie, J. C.; ; Semple, J. K.; ; Openshaw, M. G.; ; Carson, P. J. M.; ; Alex, G.; ; Andrikopoulos, B.; ; Bach, P.; ; Barclay, B.; ; Bogaert, W. S.; ; Chechi, D.; ; Cooke, K.; ; Docherty, G. S.; ; Correia, A. B.; ; Dumas, G. D. S.; ; Dunning, M. -E.; ; Fletcher, J.; ; Green, T.; ; Greenhalf, C. A.; ; Griffin, W.; ; Gupta, J. L.; ; Harrison, R. K.; ; Hiscox, E. M.; ; Wai Ho, J. A.; ; Horby, A. Y.; ; Ijaz, P. W.; ; Khoo, S.; ; Klenerman, S.; ; Law, P.; ; Lewis, A.; ; Liggi, M. R.; ; Lim, S.; ; Maslen, W. S.; ; Merson, L.; ; Meynert, L.; ; Noursadeghi, A. M.; ; Olanipekun, M.; ; Osagie, M.; ; Palmarini, A.; ; Palmieri, M.; ; Paxton, C.; ; Pollakis, W. A.; ; Price, G.; ; Russell, N.; ; Sancho-Shimizu, C. D.; ; Sands, V.; ; Scott, C. J.; ; Sigfrid, J. T.; ; Solomon, L.; ; Sriskandan, T.; ; Stuart, S.; ; Summers, D.; ; Swann, C.; ; Takats, O. V.; ; Takis, Z.; ; Tedder, P.; ; Thompson, R. S.; ; Thwaites, A. A. R.; ; Zambon, R. S.; ; Hardwick, M.; ; Donohue, H.; ; Griffiths, C.; ; Oosthuyzen, F.; ; Donegan, W.; ; Spencer, C.; ; Dalton, R. G.; ; Girvan, J.; ; Saviciute, M.; ; Roberts, E.; ; Harrison, S.; ; Marsh, J.; ; Connor, L.; ; Halpin, M.; ; Jackson, S.; ; Gamble, C.; ; Plotkin, C.; ; Lee, D.; ; Leeming, J.; ; Wham, G.; ; Clohisey, M.; ; Hendry, S.; ; Scott-Brown, R.; ; Shaw, J.; ; McDonald, V.; ; Keating, S. E.; ; Ahmed, S.; ; Armstrong, K. A.; ; Ashworth, J. A.; ; Asiimwe, M.; ; Bakshi, I. G.; ; Barlow, S.; ; Booth, S. L.; ; Brennan, L.; ; Bullock, B.; ; Catterall, K.; ; Clark, B. W. A.; ; Clarke, J. J.; ; Cole, E. A.; ; Cooper, S.; ; Cox, L.; ; Davis, H.; ; Dincarslan, C.; ; Dunn, O.; ; Dyer, C.; ; Elliott, P.; ; Evans, A.; ; Finch, A.; ; Fisher, L.; ; Foster, L. W. S.; ; Garcia-Dorival, T.; ; Gunning, I.; ; Hartley, P.; ; Jensen, C.; ; Jones, R. L.; ; Jones, C. B.; ; Khandaker, T. R.; ; King, S.; ; Kiy, K.; ; Koukorava, R. T.; ; Lake, C.; ; Lant, A.; ; Latawiec, S.; ; Lavelle-Langham, D.; ; Lefteri, L.; ; Lett, D.; ; Livoti, L.; ; Mancini, L. A.; ; McDonald, M.; ; McEvoy, S.; ; McLauchlan, L.; ; Metelmann, J.; ; Miah, S.; ; Middleton, N. S.; ; Mitchell, J.; ; Murphy, J.; ; Penrice-Randal, E. G.; ; Pilgrim, R.; ; Prince, J.; ; Reynolds, T.; ; Ridley, W.; ; Sales, P. M.; ; Shaw, D.; ; Shears, V. E.; ; Small, R. K.; ; Subramaniam, B.; ; Szemiel, K. S.; ; Taggart, A.; ; Tanianis-Hughes, A.; ; Thomas, J.; ; Trochu, J.; ; van Tonder, E.; ; Wilcock, L.; ; Zhang, E.; ; Flaherty, J. E.; ; Maziere, L.; ; Cass, N.; ; Carracedo, E.; ; Carlucci, A. D.; ; Holmes, N.; ; Massey, A.; ; Murphy, H.; ; Wrobel, L.; ; McCafferty, N.; ; Morrice, S.; ; MacLean, K.; ; Adeniji, A.; ; Agranoff, K.; ; Agwuh, D.; ; Ail, K.; ; Aldera, D.; ; Alegria, E. L.; ; Allen, A.; ; Angus, S.; ; Ashish, B.; ; Atkinson, A.; ; Bari, D.; ; Barlow, S.; ; Barnass, G.; ; Barrett, S.; ; Bassford, N.; ; Basude, C.; ; Baxter, S.; ; Beadsworth, D.; ; Bernatoniene, M.; ; Berridge, J.; ; Berry, J.; ; Best, C.; ; Bothma, N.; ; Chadwick, P.; ; Brittain-Long, D.; ; Bulteel, R.; ; Burden, N.; ; Burtenshaw, T.; ; Caruth, A.; ; Chambler, V.; ; Chee, D.; ; Child, N.; ; Chukkambotla, J.; ; Clark, S.; ; Collini, T.; ; Cosgrove, P.; ; Cupitt, C.; ; Cutino-Moguel, J.; ; Dark, M. -T.; ; Dawson, P.; ; Donnison, C.; ; Douthwaite, P.; ; Drummond, S.; ; DuRand, A.; ; Dushianthan, I.; ; Dyer, A.; ; Eziefula, T.; ; Fegan, C.; ; Finn, C.; ; Fullerton, A.; ; Garg, D.; ; Garg, S.; ; Gkrania-Klotsas, A.; ; Godden, E.; ; Goldsmith, J.; ; Hardy, A.; ; Hartshorn, E.; ; Harvey, S.; ; Havalda, D.; ; Hawcutt, P.; ; Hobrok, D. B.; ; Hodgson, M.; ; Hormis, L.; ; Jacobs, A.; ; Jain, M.; ; Jennings, S.; ; Kaliappan, P.; ; Kasipandian, A.; ; Kegg, V.; ; Kelsey, S.; ; Kendall, M.; ; Kerrison, J.; ; Kerslake, C.; ; Koch, I.; ; Koduri, O.; ; Koshy, G.; ; Laha, G.; ; Laird, S.; ; Larkin, S.; ; Leiner, S.; ; Lillie, T.; ; Limb, P.; ; Linnett, J.; ; Little, V.; ; Lyttle, J.; ; MacMahon, M.; ; Mankregod, M.; ; Masson, R.; ; Matovu, H.; ; McCullough, E.; ; McEwen, K.; ; Meda, R.; ; Mills, M.; ; Minton, G.; ; Mohandas, J.; ; Mok, K.; ; Moon, Q.; ; Moore, J.; ; Morgan, E.; ; Morris, P.; ; Mortimore, C.; ; Mpenge, K.; ; Mulla, M.; ; Murphy, R.; ; Nagel, M.; ; Nagarajan, M.; ; Nelson, T.; ; Norris, M.; ; O'Shea, L.; ; Otahal, M. K.; ; Ostermann, I.; ; Pais, M.; ; Panchatsharam, M.; ; Papakonstantinou, S.; ; Paraiso, D.; ; Patel, H.; ; Pattison, B.; ; Pepperell, N.; ; Peters, J.; ; Phull, M.; ; Pintus, M.; ; Pooni, S.; ; Planche, J. 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L.; ; COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium; ISARIC4C Investigators, T.

doi:10.1016/j.isci.2021.103353

The impact of viral mutations on recognition by SARS-CoV-2 specific T cells

de Silva;T. I. ; Liu;G. ; Lindsey;B. B. ; Dong;D. ; Moore;S. C. ; Hsu;N. S. ; Shah;D. ; Wellington;D. ; Mentzer;A. J. ; Angyal;A. ; Brown;R. ; Parker;M. D. ; Ying;Z. ; Yao;X. ; Turtle;L. ; Dunachie;S. ; Aanensen;D. M. ; Abudahab;K. ; Adams;H. ; Adams;A. ; Afifi;S. ; Aggarwal;D. ; Ahmad;S. S. Y. ; Aigrain;L. ; Alcolea-Medina;A. ; Alikhan;N. -F. ; Allara;E. ; Amato;R. ; Annett;T. ; Aplin;S. ; Ariani;C. V. ; Asad;H. ; Ash;A. ; Ashfield;P. ; Ashford;F. ; Atkinson;L. ; Attwood;S. W. ; Auckland;C. ; Aydin;A. ; Baker;D. J. ; Baker;P. ; Balcazar;C. E. ; Ball;J. ; Barrett;J. C. ; Barrow;M. ; Barton;E. ; Bashton;M. ; Bassett;A. R. ; Batra;R. ; Baxter;C. ; Bayzid;N. ; Beaver;C. ; Beckett;A. H. ; Beckwith;S. M. ; Bedford;L. ; Beer;R. ; Beggs;A. ; Bellis;K. L. ; Berry;L. ; Bertolusso;B. ; Best;A. ; Betteridge;E. ; Bibby;D. ; Bicknell;K. ; Binns;D. ; Birchley;A. ; Bird;P. W. ; Bishop;C. ; Blacow;R. ; Blakey;V. ; Blane;B. ; Bolt;F. ; Bonfield;J. ; Bonner;S. ; Bonsall;D. ; Boswell;T. ; Bosworth;A. ; Bourgeois;Y. ; Boyd;O. ; Bradley;D. T. ; Breen;C. ; Bresner;C. ; Breuer;J. ; Bridgett;S. ; Bronner;I. F. ; Brooks;E. ; Broos;A. ; Brown;J. R. ; Bucca;G. ; Buchan;S. L. ; Buck;D. ; Bull;M. ; Burns;P. J. ; Burton-Fanning;S. ; Byaruhanga;T. ; Byott;M. ; Campbell;S. ; Carabelli;A. M. ; Cargill;J. S. ; Carlile;M. ; Carvalho;S. F. ; Casey;A. ; Castigador;A. ; Catalan;J. ; Chalker;V. ; Chaloner;N. J. ; Chand;M. ; Chappell;J. G. ; Charalampous;T. ; Chatterton;W. ; Chaudhry;Y. ; Churcher;C. M. ; Clark;G. ; Clarke;P. ; Cogger;B. J. ; Cole;K. ; Collins;J. ; Colquhoun;R. ; Connor;T. R. ; Cook;K. F. ; Coombes;J. ; Corden;S. ; Cormie;C. ; Cortes;N. ; Cotic;M. ; Cotton;S. ; Cottrell;S. ; Coupland;L. ; Cox;M. ; Cox;A. ; Craine;N. ; Crawford;L. ; Cross;A. ; Crown;M. R. ; Crudgington;D. ; Cumley;N. ; Curran;T. ; Curran;M. D. ; da Silva Filipe;A. ; Dabrera;G. ; Darby;A. C. ; Davidson;R. K. ; Davies;A. ; Davies;R. M. ; Davis;T. ; de Angelis;D. ; De Lacy;E. ; de Oliveira Martins;L. ; Debebe;J. ; Denton-Smith;R. ; Dervisevic;S. ; Dewar;R. ; Dey;J. ; Dias;J. ; Dobie;D. ; Dorman;M. J. ; Downing;F. ; Driscoll;M. ; du Plessis;L. ; Duckworth;N. ; Durham;J. ; Eastick;K. ; Easton;L. J. ; Eccles;R. ; Edgeworth;J. ; Edwards;S. ; El Bouzidi;K. ; Eldirdiri;S. ; Ellaby;N. ; Elliott;S. ; Eltringham;G. ; Ensell;L. ; Erkiert;M. J. ; Zamudio;M. E. ; Essex;S. ; Evans;J. M. ; Evans;C. ; Everson;W. ; Fairley;D. J. ; Fallon;K. ; Fanaie;A. ; Farr;B. W. ; Fearn;C. ; Feltwell;T. ; Ferguson;L. ; Fina;L. ; Flaviani;F. ; Fleming;V. M. ; Forrest;S. ; Foster-Nyarko;E. ; Foulkes;B. H. ; Foulser;L. ; Fragakis;M. ; Frampton;D. ; Francois;S. ; Fraser;C. ; Freeman;T. M. ; Fryer;H. ; Fuchs;M. ; Fuller;W. ; Gajee;K. ; Galai;K. ; Gallagher;A. ; Gallagher;E. ; Gallagher;M. D. ; Gallis;M. ; Gaskin;A. ; Gatica-Wilcox;B. ; Geidelberg;L. ; Gemmell;M. ; Georgana;I. ; George;R. P. ; Gifford;L. ; Gilbert;L. ; Girgis;S. T. ; Glaysher;S. ; Goldstein;E. J. ; Golubchik;T. ; Gomes;A. N. ; Gonçalves;S. ; Goodfellow;I. G. ; Goodwin;S. ; Goudarzi;S. ; Gourtovaia;M. ; Graham;C. ; Graham;L. ; Grant;P. R. ; Green;L. R. ; Green;A. ; Greenaway;J. ; Gregory;R. ; Guest;M. ; Gunson;R. N. ; Gupta;R. K. ; Gutierrez;B. ; Haldenby;S. T. ; Hamilton;W. L. ; Hansford;S. E. ; Haque;T. ; Harris;K. A. ; Harrison;I. ; Harrison;E. M. ; Hart;J. ; Hartley;J. A. ; Harvey;W. T. ; Harvey;M. ; Hassan-Ibrahim;M. O. ; Heaney;J. ; Helmer;T. ; Henderson;J. H. ; Hesketh;A. R. ; Hey;J. ; Heyburn;D. ; Higginson;E. E. ; Hill;V. ; Hill;J. D. ; Hilson;R. A. ; Hilvers;E. ; Holden;M. T. G. ; Hollis;A. ; Holmes;C. W. ; Holmes;N. ; Holmes;A. H. ; Hopes;R. ; Hornsby;H. R. ; Hosmillo;M. ; Houlihan;C. ; Howson-Wells;H. C. ; Hubb;J. ; Huckson;H. ; Hughes;W. ; Hughes;J. ; Hughes;M. ; Hutchings;S. ; Idle;G. ; Illingworth;C. J. ; Impey;R. ; Irish-Tavares;D. ; Iturriza-Gomara;M. ; Izuagbe;R. ; Jackson;C. ; Jackson;B. ; Jackson;L. M. ; Jackson;K. A. ; Jackson;D. K. ; Jahun;A. S. ; James;V. ; James;K. ; Jeanes;C. ; Jeffries;A. R. ; Jeremiah;S. ; Jermy;A. ; John;M. ; Johnson;R. ; Johnson;K. ; Johnston;I. ; Jones;O. ; Jones;S. ; Jones;H. ; Jones;C. R. ; Jones;N. ; Joseph;A. ; Judges;S. ; Kay;G. L. ; Kay;S. ; Keatley;J. -P. ; Keeley;A. J. ; Kenyon;A. ; Kermack;L. M. ; Khakh;M. ; Kidd;S. P. ; Kimuli;M. ; Kirk;S. ; Kitchen;C. ; Kitchman;K. ; Knight;B. A. ; Koshy;C. ; Kraemer;M. U. G. ; Kumziene-Summerhayes;S. ; Kwiatkowski;D. ; Lackenby;A. ; Laing;K. G. ; Lampejo;T. ; Langford;C. F. ; Lavin;D. ; Lawton;A. I. ; Lee;J. ; Lee;D. ; Lensing;S. V. ; Leonard;S. ; Levett;L. J. ; Le-Viet;T. ; Lewis;J. ; Lewis;K. ; Liddle;J. ; Liggett;S. ; Lillie;P. J. ; Lister;M. M. ; Livett;R. ; Lo;S. ; Loman;N. J. ; Loose;M. W. ; Louka;S. F. ; Loveson;K. F. ; Lowdon;S. ; Lowe;H. ; Lowe;H. L. ; Lucaci;A. O. ; Ludden;C. ; Lynch;J. ; Lyons;R. A. ; Lythgoe;K. ; Machin;N. W. ; MacIntyre-Cockett;G. ; Mack;A. ; Macklin;B. ; Maclean;A. ; Macnaughton;E. ; Madona;P. ; Maes;M. ; Maftei;L. ; Mahanama;A. I. K. ; Mahungu;T. W. ; Mair;D. ; Maksimovic;J. ; Malone;C. S. ; Maloney;D. ; Manesis;N. ; Manley;R. ; Mantzouratou;A. ; Marchbank;A. ; Mariappan;A. ; Martincorena;I. ; Martinez Nunez;R. T. ; Mather;A. E. ; Maxwell;P. ; Mayhew;M. ; Mbisa;T. ; McCann;C. M. ; McCarthy;S. A. ; McCluggage;K. ; McClure;P. C. ; McCrone;J. T. ; McHugh;M. P. ; McKenna;J. P. ; McKerr;C. ; McManus;G. M. ; McMurray;C. L. ; McMurray;C. ; McNally;A. ; Meadows;L. ; Medd;N. ; Megram;O. ; Menegazzo;M. ; Merrick;I. ; Michell;S. L. ; Michelsen;M. L. ; Mirfenderesky;M. ; Mirza;J. ; Miskelly;J. ; Moles-Garcia;E. ; Moll;R. J. ; Molnar;Z. ; Monahan;I. M. ; Mondani;M. ; Mookerjee;S. ; Moore;C. ; Moore;J. ; Moore;N. ; Moore;C. ; Morcrette;H. ; Morgan;S. ; Morgan;M. ; Mori;M. ; Morriss;A. ; Moses;S. ; Mower;C. ; Muir;P. ; Mukaddas;A. ; Munemo;F. ; Munn;R. ; Murray;A. ; Murray;L. J. ; Murray;D. R. ; Mutingwende;M. ; Myers;R. ; Nastouli;E. ; Nebbia;G. ; Nelson;A. ; Nelson;C. ; Nicholls;S. ; Nichols;J. ; Nicodemi;R. ; Nomikou;K. ; O'Grady;J. ; O'Brien;S. ; Odedra;M. ; Ohemeng-Kumi;N. ; Oliver;K. ; Orton;R. J. ; Osman;H. ; xeine O'Toole; Pacchiarini;N. ; Padgett;D. ; Page;A. J. ; Park;E. J. ; Park;N. R. ; Parmar;S. ; Partridge;D. G. ; Pascall;D. ; Patel;A. ; Patel;B. ; Paterson;S. ; Payne;B. A. I. ; Peacock;S. J. ; Pearson;C. ; Pelosi;E. ; Percival;B. ; Perkins;J. ; Perry;M. ; Pinckert;M. L. ; Platt;S. ; Podplomyk;O. ; Pohare;M. ; Pond;M. ; Pope;C. F. ; Poplawski;R. ; Powell;J. ; Poyner;J. ; Prestwood;L. ; Price;A. ; Price;J. R. ; Prieto;J. A. ; Pritchard;D. T. ; Prosolek;S. J. ; Pugh;G. ; Pusok;M. ; Pybus;O. G. ; Pymont;H. M. ; Quail;M. A. ; Quick;J. ; Radulescu;C. ; Raghwani;J. ; Ragonnet-Cronin;M. ; Rainbow;L. ; Rajan;D. ; Rajatileka;S. ; Ramadan;N. A. ; Rambaut;A. ; Ramble;J. ; Randell;P. A. ; Randell;P. ; Ratcliffe;L. ; Raviprakash;V. ; Raza;M. ; Redshaw;N. M. ; Rey;S. ; Reynolds;N. ; Richter;A. ; Robertson;D. L. ; Robinson;E. ; Robson;S. C. ; Rogan;F. ; Rooke;S. ; Rowe;W. ; Roy;S. ; Rudder;S. ; Ruis;C. ; Rushton;S. ; Ryan;F. ; Saeed;K. ; Samaraweera;B. ; Sambles;C. M. ; Sanderson;R. ; Sanderson;T. ; Sang;F. ; Sass;T. ; Scher;E. ; Scott;G. ; Scott;C. ; Sehmi;J. ; Shaaban;S. ; Shah;D. ; Shaw;J. ; Shelest;E. ; Shepherd;J. G. ; Sheridan;L. A. ; Sheriff;N. ; Shirley;L. ; Sillitoe;J. ; Silviera;S. ; Simpson;D. A. ; Singh;A. ; Singleton;D. ; Skvortsov;T. ; Sloan;T. J. ; Sluga;G. ; Smith;K. ; Smith;K. S. ; Smith;P. ; Smith;D. L. ; Smith;L. ; Smith;C. P. ; Smith;N. ; Smollett;K. L. ; Snell;L. B. ; Somassa;T. ; Southgate;J. ; Spellman;K. ; Spencer Chapman;M. H. ; Spurgin;L. G. ; Spyer;M. J. ; Stanley;R. ; Stanley;W. ; Stanton;T. D. ; Starinskij;I. ; Stockton;J. ; Stonehouse;S. ; Storey;N. ; Studholme;D. J. ; Sudhanva;M. ; Swindells;E. ; Taha;Y. ; Tan;N. K. ; Tang;J. W. ; Tang;M. ; Taylor;B. E. W. ; Taylor;J. F. ; Taylor;S. ; Temperton;B. ; Templeton;K. E. ; Thomas;C. ; Thomson;L. ; Thomson;E. C. ; Thornton;A. ; Thurston;S. A. J. ; Todd;J. A. ; Tomb;R. ; Tong;L. ; Tonkin-Hill;G. ; Torok;M. E. ; Tovar-Corona;J. M. ; Trebes;A. ; Trotter;A. J. ; Tsatsani;I. ; Turnbull;R. ; Twohig;K. A. ; Umpleby;H. ; Underwood;A. P. ; Vamos;E. E. ; Vasylyeva;T. I. ; Vattipally;S. ; Vernet;G. ; Vipond;B. B. ; Volz;E. M. ; Walsh;S. ; Wang;D. ; Warne;B. ; Warwick-Dugdale;J. ; Wastnedge;E. ; Watkins;J. ; Watson;L. K. ; Waugh;S. ; Webster;H. J. ; Weldon;D. ; Westwick;E. ; Whalley;T. ; Wheeler;H. ; Whitehead;M. ; Whiteley;M. ; Whitwham;A. ; Wierzbicki;C. ; Willford;N. J. ; Williams;L. -A. ; Williams;R. ; Williams;C. ; Williams;C. ; Williams;C. A. ; Williams;R. J. ; Williams;T. ; Williams;C. ; Williamson;K. A. ; Wilson-Davies;E. ; Witele;E. ; Withell;K. T. ; Witney;A. A. ; Wolverson;P. ; Wong;N. ; Workman;T. ; Wright;V. ; Wright;D. W. ; Wyatt;T. ; Wyllie;S. ; Xu-McCrae;L. ; Yavus;M. ; Yaze;G. ; Yeats;C. A. ; Yebra;G. ; Yew;W. C. ; Young;G. R. ; Young;J. ; Zarebski;A. E. ; Zhang;P. ; Maini;M. K. ; Ogg;G. ; Knight;J. C. ; Baillie;J. K. ; Semple;M. G. ; Openshaw;P. J. M. ; Carson;G. ; Alex;B. ; Andrikopoulos;P. ; Bach;B. ; Barclay;W. S. ; Bogaert;D. ; Chechi;K. ; Cooke;G. S. ; Docherty;A. B. ; Correia;G. D. S. ; Dumas;M. -E. ; Dunning;J. ; Fletcher;T. ; Green;C. A. ; Greenhalf;W. ; Griffin;J. L. ; Gupta;R. K. ; Harrison;E. M. ; Hiscox;J. A. ; Wai Ho;A. Y. ; Horby;P. W. ; Ijaz;S. ; Khoo;S. ; Klenerman;P. ; Law;A. ; Lewis;M. R. ; Liggi;S. ; Lim;W. S. ; Maslen;L. ; Merson;L. ; Meynert;A. M. ; Noursadeghi;M. ; Olanipekun;M. ; Osagie;A. ; Palmarini;M. ; Palmieri;C. ; Paxton;W. A. ; Pollakis;G. ; Price;N. ; Russell;C. 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The impact of viral mutations on recognition by SARS-CoV-2 specific T cells

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